1910年秋，陳方恪畢業(yè)于復(fù)旦公學(xué)，因?yàn)槿齻€(gè)兄長(zhǎng)皆在外謀職或求學(xué)，所以留在江蘇江寧侍奉父母。1912年冬，應(yīng)狄葆賢之邀，陳方恪到上海任《時(shí)報(bào)》編輯。后又經(jīng)梁?jiǎn)⒊榻B，進(jìn)入上海中華書局，任雜志部主任。還在商務(wù)印書館、《民立報(bào)》及《時(shí)事新報(bào)》做過編輯，并參加南社詩(shī)人們?cè)谏虾Ｖ偶?。在與名士交游過程中，沾染上阿芙蓉癖，一生為之所累。又曾隨報(bào)界同仁拜過洪幫老頭子，加入幫會(huì)，且在洪門中有較高輩份。 1920年秋經(jīng)時(shí)任總統(tǒng)徐世昌等父執(zhí)推薦，南下江西南昌淘金。在此后幾年之中，得到贛省多任督軍眷顧，先后擔(dān)任江西圖書館館長(zhǎng)、景德鎮(zhèn)稅務(wù)局局長(zhǎng)、田畝丈量局局長(zhǎng)、釐金局局長(zhǎng)以及地方關(guān)口稅務(wù)局等肥差，職務(wù)調(diào)動(dòng)頻繁，日進(jìn)斗金，宦囊充溢。其間陳方恪曾多次攜金返滬，并結(jié)識(shí)小他十歲的孔紫萸（1901—1951），兩人一見傾心，私定良期。1924年春，江西境內(nèi)局勢(shì)不穩(wěn)，陳方恪返回上海，攜孔紫萸歸南京，同居于散原精舍內(nèi)。家人與親友得知孔氏身世，均極力反對(duì)，但陳方恪不為所動(dòng)。陳孔兩人終生未辦理婚宴，恐怕即與此有關(guān)乎？

　　后應(yīng)父執(zhí)唐文治聘請(qǐng)，重回滬上，任教于無錫國(guó)學(xué)專修館分校，教授古典詩(shī)詞課程。同時(shí)又在暨南大學(xué)、持志大學(xué)、私立正風(fēng)學(xué)院等校兼課。陳方恪后來曾對(duì)自己年輕時(shí)荒誕之舉有所反思，頗感悔意：“予頻年以來，飄萍南北，青眼未逢，黃塵何極！獨(dú)優(yōu)伶倡伎之中不少激楚流連之子，漸成傾蓋之交，感締蘊(yùn)袍之約，緯繣至今，負(fù)人者多矣。”1937年9月14日陳三立在北平謝世，享年八十五歲。因時(shí)局動(dòng)蕩，交通不暢，暫將靈柩厝存于北平長(zhǎng)椿寺內(nèi)。陳方恪原任教之上海正風(fēng)學(xué)院校舍被日本飛機(jī)炸毀，加之日軍肆虐，治安環(huán)境險(xiǎn)惡，遂告停學(xué)，師生遣散，經(jīng)濟(jì)失去來源，生活異常拮據(jù)。

　　1938年3月梁鴻志等人在日本人扶持下于南京成立“中華民國(guó)維新政府”。陳方恪與梁為詩(shī)文知己，梁亦經(jīng)常接濟(jì)陳家，故交誼頗深。同年十一月，陳方恪確因家室開支所累，被梁鴻志、陳群等昔日友人拉攏至南京，后被聘為教育部編審。

　　陳方恪在年底將家屬、仆人接到南京，租居于城南長(zhǎng)樂路。后陳方恪又先后被聘為汪偽政府考試院“考選專門委員會(huì)專門委員”、偽“南京國(guó)學(xué)圖書館館長(zhǎng)”、偽“中國(guó)文藝協(xié)會(huì)”理事等職，皆因夫婦兩人鴉片煙癮過大，加之應(yīng)酬較多，入不敷出之故。次年年底，陳方恪開始與抗日地下組織人員來往。1943年春天，早年在上海結(jié)識(shí)之洪幫同門兄弟、時(shí)為重慶軍統(tǒng)局重要骨干徐亮秘密派遣特工馬杰潛入南京，并與陳方恪取得聯(lián)系，邀其加入地下抗日組織，陳態(tài)度積極。后報(bào)經(jīng)重慶方面同意，正式成為軍統(tǒng)運(yùn)用人員，并確定了化名與職務(wù)。分配其主要任務(wù)是掩護(hù)在南京之軍統(tǒng)潛伏組，搜集汪偽政府情報(bào)，并盡可能對(duì)汪偽高官中之陳公博、繆斌等人進(jìn)行聯(lián)絡(luò)與策反。不久，潛伏組將電臺(tái)藏入金陵刻經(jīng)處，報(bào)務(wù)員則以遠(yuǎn)房親戚身份長(zhǎng)住刻經(jīng)處，因當(dāng)時(shí)敵后特工人員經(jīng)費(fèi)時(shí)斷時(shí)續(xù)，故陳方恪常常為之借債籌款以解日常開支之急。與此同時(shí)，還與中共情報(bào)人員徐光楚等人有過秘密接觸。由于潛伏電臺(tái)經(jīng)常在深夜工作，電波信號(hào)被日軍憲兵司令部情報(bào)人員具體測(cè)出方位。后偵知其中有涉及汪偽政府高官，故未輕易采取行動(dòng)，秘密監(jiān)視，以靜制動(dòng)，試圖一網(wǎng)打盡。同年七月，汪精衛(wèi)簽發(fā)“第伍壹叁號(hào)國(guó)民政府令”：任命陳方恪為國(guó)民政府秘書。

　　1945年3月某日，軍統(tǒng)特工金志濤在上海開往南京之火車上伏擊一名日本軍官，從其隨身皮包內(nèi)獲得一份重要情報(bào)，隨即用電報(bào)發(fā)往重慶。金托陳方恪銷毀情報(bào)資料，但其中有一份圖表因價(jià)值較高，陳方恪未忍銷毀，攜歸后藏于一本線裝詩(shī)集封套里。此時(shí)日軍憲兵隊(duì)已派遣便衣從多方面監(jiān)視金陵刻經(jīng)處，隨時(shí)準(zhǔn)備闖入抓人。而入住刻經(jīng)處之軍統(tǒng)特工與電臺(tái)已無法再轉(zhuǎn)移出去，只得將密碼本燒毀，將電臺(tái)藏于刻經(jīng)工人房?jī)?nèi)。

　　8月5日下午，一隊(duì)日軍憲兵沖進(jìn)金陵刻經(jīng)處，直奔后院，將兩名軍統(tǒng)特工捕獲，電臺(tái)也被搜出，另有三名工人亦被捕。陳方恪恰巧正遇朋友在門外談話，見事不妙，乘亂混出大門之后，立即電話通知繆斌及隱藏在某醫(yī)院內(nèi)之金志濤，隨即躲入密友家中，繆斌聞?dòng)嵓刺油虾?。日軍憲兵開始搜查其房間，甚至將室內(nèi)地板一一撬起。孔紫萸乘憲兵不備，將藏有日軍圖表之線裝詩(shī)集扔進(jìn)在燃火之灶膛內(nèi)。陳方恪遂托人向汪偽政府高官陳公博、陳群、梅思平等人求救。次日早晨，其回家探聽風(fēng)聲時(shí)，被守候之日軍憲兵抓獲，隨即押往憲兵隊(duì)，關(guān)在地下室里。在審問時(shí)，對(duì)刻經(jīng)處所藏軍統(tǒng)電臺(tái)推說毫不知情，僅是借房屋給不認(rèn)識(shí)人居住。又逼問此事與汪偽高官繆斌等人是否有關(guān)聯(lián)，亦堅(jiān)不吐露實(shí)情，遭受嚴(yán)刑逼供。后經(jīng)汪偽高官與日軍將領(lǐng)疏通，三天后，刻經(jīng)處三位工人被釋放，但陳方恪因案情嚴(yán)重，又不予“配合”，繼續(xù)羈押。

　　8月9日，陳方恪被憲兵押往上海，在駐滬日軍協(xié)助下，包圍繆斌位于紹興路上之寓所。一欲捕獲繆斌與陳對(duì)質(zhì)，另欲捕獲其他軍統(tǒng)特工。此日電臺(tái)中已經(jīng)廣播蘇聯(lián)對(duì)日宣戰(zhàn)消息，日軍聞之皆神情沮喪，已無心再深入追查，遂將陳方恪押回南京。又倍受酷刑折磨，險(xiǎn)些喪命。8月14日，電臺(tái)中播放日本天皇宣布投降消息，日軍已經(jīng)自顧不暇，無人再過問陳方恪案件。次日，經(jīng)過汪偽官員居間調(diào)停，日軍允許擔(dān)保假釋，但須隨傳隨到。僅短短十天時(shí)間，陳方恪已是滿頭白發(fā)，瘦骨嶙峋，體重僅四十余斤。

　　9月下旬，軍統(tǒng)局要員飛抵南京、上海等地，視察接受敵偽資產(chǎn)和布置肅奸事宜。同時(shí)召見一些在抗日期間有功之軍統(tǒng)地下特工人員，予以慰問和嘉獎(jiǎng)，傳陳方恪亦在其中。1946年年底，軍統(tǒng)局改編為國(guó)防部保密局，編制縮小，大量裁員，遂解除與陳方恪關(guān)系。然對(duì)其當(dāng)年曾借款資助軍統(tǒng)潛伏人員開支，卻未予以應(yīng)有之經(jīng)濟(jì)補(bǔ)償。據(jù)傳后來身居軍情系統(tǒng)要職之洪門兄弟徐亮，也僅用幾塊煙土以私人名義予以象征性補(bǔ)償而已。

　　解放后，陳方恪已失業(yè)，困守在南京城南飲馬巷的兩間舊房里。1950年，陳毅在一次專門招待南京文化名流的宴會(huì)上，聞知漏請(qǐng)了散原老人之子陳方恪，就立即派人登門請(qǐng)他赴宴。不久，在南京市政府的安排下，陳方恪一家遷往四衛(wèi)頭54號(hào)居住，生活才算是安定了下來。1959年，毛澤東在一次宴會(huì)上提到了陳寶箴任湖南撫臺(tái)時(shí)，銳意新政，戊戌年間保薦了康有為等豪杰之士，且注重文化啟蒙，業(yè)績(jī)冠于各省。毛主席自己當(dāng)年讀的湖南第一師范，就是這位撫臺(tái)大人創(chuàng)辦的。后來又問起了陳氏后人的下落，陳毅一一介紹之后，又說到陳家有一個(gè)老七陳方恪在南京。 也許是這個(gè)原因，不久在省市有關(guān)部門的關(guān)照下，陳方恪家又遷到了牯嶺路26號(hào)的小洋樓里，陳本人也被安排在《江海學(xué)刊》雜志社任編輯。1966年1月3日陳方恪逝世于南京，享年75歲。后人輯有《陳方恪詩(shī)詞集》一冊(cè)。